化学生物学实验预习思考题
“疏水作用色谱分离纯化α-淀粉酶”实验
1、常用的蛋白质分离纯化的方法有哪些，简述各种方法的原理。
2、疏水层析的分离原理是什么？影响疏水作用的因素主要有那些？
3、为什么可以用疏水层析分离α-淀粉酶？
4、可以采用哪些方案，提高α-淀粉酶的分离效果？
“生物矿物和生物矿化”实验
1、贝壳和鸡蛋壳的主要差异有哪些？
2、聚（4－乙烯苯磺酸钠）的作用有哪些？
3、指出影响碳酸钙晶型的可能因素有哪些？
4、如何制备各种形状的纳米碳酸钙？
5、试举一个身边的生物矿化例子，并尝试了解和叙述其中可能的矿化过程。
“植物组织中叶绿体基因的提取与扩增”实验
1、在提取DNA时加入氯仿并混合离心后溶液会分成三层，每层都是什么？
2、如何通过氯仿分层这一步将蛋白除去？
3、用紫外可见分光光度计检验提取DNA纯度时为何要求OD260/OD280比值为1.7~1.9？过低或过高说明什么问题？
4、植物DNA的抽提常用方法有哪些，其原理分别是什么？
“非水相酶催化反应”实验
1、在Markovnikov加成反应中，酶催化剂与其他化学催化剂各有哪些优势？
2、影响本实验产率的因素有哪些，如何提高产率？
3、受体结构对Markovnikov加成反应活性有什么样的影响？
4、本反应过程中如何体现酶催化的高度选择性？
5、查阅资料，说明如何利用仪器分析表征手段来判断两种反应条件下2’-脱氧尿苷的不同酯化位置？
6、酶促反应的选择性还受哪些因素的影响吗？查阅资料，举一个相关的例子
“MTT法测定聚乙烯亚胺（PEI）的细胞毒性”实验
1、MTT法的原理是什么？
2、除MTT法外，还有哪些方法可以测定细胞毒性？
3、如何用细胞记数法，计算细胞悬浮液中细胞的浓度？
“泛素蛋白的驾驭式分子动力学模拟”实验
1、在接触本实验前，你做过计算机分子模拟实验吗？你对计算机分子模拟有过一些什么样的认识？进行分子动力学模拟应做好哪些准备工作？
2、什么是操控式分子动力学模拟？操控式分子动力学模拟的基本原理是什么？通过操控式分子动力学模拟我们可以得到哪些信息？
3、为什么说力场对分子动力学模拟的准确性至关重要？你还知道有哪些模型适用于生物大分子的模拟？
4、什么是周期性边界条件？为什么要用周期性边界条件？分子模拟中总是使用周期性边界条件吗？
5、操控式分子动力学对生物大分子的模拟与实验相比有什么优点？
“金属卟啉模拟的生物氧化过程”实验
1、生物氧化的意义是什么？
2、生物氧化过程与非生物氧化过程有什么样的区别？
3、四苯基-卟啉铜为什么能催化氧化β-异佛尔酮？在氧化过程中金属起什么样的作用？
4、在使用紫外分光光度计检测金属卟啉吸氧过程时，金属卟啉的浓度并没有发生改变，但其最大吸光度却随时间发生变化，这是为什么？
“亲和层析法从鸡蛋清中分离溶菌酶”实验
1、查阅资料，简述柱层析的种类及其应用。
2、亲和层析的基本原理是什么？
3、壳聚糖树脂制备时，为何要彻底去除其分子上的游离氨基？
4、为什么要选择新鲜鸡蛋为原料来分离提纯溶菌酶？
5、蛋清处理时，为何要先将pH调至4.5，再80℃水浴加热5min？
“PCR-RFLP法检测单核苷酸多态性”实验
1、单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）检测的意义是什么？
2、单核苷酸多态性检测的主要方法有哪些？
3、聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性（PCR-Restriction fragment length polymorphism，PCR-RFLP）分析技术的原理是什么？
4、常见限制性内切酶有哪些，每种具体用法如何？
5、对于突变不能引起酶切位点变化的SNP如何检测？
6、对于未知突变位点的情况可以采用什么技术进行SNP检测？
7、在这个实验中有什么收获吗？谈谈你的意见和建议
“大肠杆菌感受态细胞制备与质粒DNA的转化”实验
1、什么叫感受态细胞？
2、CaCl2法制备感受态细胞的原理是什么？
3、制备感受态细胞时，应特别注意哪些环节？
4、为了提高转化效率，实验中要考虑哪些因素？
5、如何计算转化效率？
6、如果转化效率过低，请分析可能的原因。
“蛋白质在羟磷灰石上吸附-脱附过程的分子模拟”实验
1、你认为使用分子模拟软件可以在哪些领域开展研究？
2、本实验中是怎样从微观物理量获得分子系统性质的？
3、什么是系统的微观状态？举例说明。微观状态与系统的宏观性质关系如何？
4、为什么说力场对分子动力学模拟的准确性至关重要？你还知道有什么力场模型吗？
5、使用扰动的方法研究蛋白质与无机晶体之间的相互作用有什么优越性？
“抗肿瘤药物对肿瘤细胞抑制及细胞形态观察”实验
1、查阅文献，阐述细胞染色的其他方法。
2、在细胞染色后，如何选取阳性对照和阴性对照。
3、为什么抗肿瘤药物对肿瘤细胞的形态有抑制作用？
4、除了教材中所列出的注意事项外，还有哪些环节需要注意？
“荧光量子点的合成及FRET法测定蛋白酶的活性”实验
1、何谓“荧光共振能量转移现象”（fluorescence resonance energy transfer, FRET）？
2、请查阅一些资料，举例说明蛋白酶与哪些疾病的发病机制及诊断有关？
3、基于量子点与荧光染料分子间的FRET现象测定蛋白酶活力与普通的蛋白酶活力测定法相比，有何优越性？其潜在的应用领域是什么？
4、如果要进行蛋白酶抑制剂的活性测定，如何用本实验建立的体系设计新的实验方案？
